小分子藥物：
常用的主要溶劑有：甲醇（MeOH)、乙腈（ACN) 、二甲基亞砜（DMSO)、N，N-二甲基乙酰胺（DMA)、和水等，如無特殊要求，通常采用DMSO；常用的輔助溶劑有：氨水、甲酸和乙酸（醋酸）等，且一般情況下輔助溶劑的使用體積不大于溶劑總體積的1%。
多肽藥物：
一般來說，少于6個氨基酸的多肽序列，可溶于水中。
多于6個氨基酸的多肽序列，可根據其整體電荷數和疏水性選擇合適的溶解方式。
a)將酸性殘基電荷數定義為-1，包括Asp (D)、 Glu (E)和C端 (-COOH)。
b)將堿性殘基電荷數定義為+1，包括Arg (R)、 Lys (K)、 His (H) 和N端 (-NH2)。
整體電荷是負值 a.首先，取部分多肽，嘗試將其溶解在純水中； b.如果純水溶解失敗，另取多肽溶解在NH4OH中； c.如果多肽仍然不溶解，則另取多肽，嘗試添加DMSO溶解，然后稀釋溶液至所需濃度。 |
整體電荷是0 a.首先，取部分多肽，嘗試使用乙腈、甲醇水溶液等溶劑進行溶解； b.如果多肽不溶解，則另取多肽，嘗試添加DMSO進行溶解，然后稀釋至所需濃度。 |
整體電荷是正值 a.首先，取部分多肽，嘗試將其溶解在純水中； b.如果純水溶解失敗，另取多肽溶解在10%-30%乙酸中； c.如果多肽仍不溶解，則另取多肽，嘗試使用DMSO溶解，然后稀釋至所需濃度。 |
需注意：
1. 建議多肽儲存溶液的濃度是1-2 mg/ml。
2. 普通多肽凍干粉可在-20°C保存一年以上，對于已溶解的多肽，建議分裝后儲存在-20°C（或-80°C）；建議含蛋氨酸、半胱氨酸、色氨酸
殘基的多肽存儲在無氧的環境中，避免氧化。
